I use and recommend the http://yui.github.io/yuidoc is very easy to use and quite complete.
It generates documentation from the comments in the code, in a format similar to Jsdoc:
Classes
/**
* Descrição da classe.
*
* @class MinhaClasse
* @constructor
*/
Methods
/**
* Descrição do método. Como qualquer outro comentário,
* podem ocorrer quebras de linha sem problema.
*
* @method nomeMetodo
* @param {String} foo Parâmetro 1
* @param {Object} config Objeto de configuração
* @param {String} config.name Nome do objeto de config
* @param {Function} config.callback Callback do objeto de configuração
* @param {Boolean} [extra=false] Parâmetro extra, opcional
* @return {Boolean} Retorna true se bem sucedido
*/
To generate the documentation, just run yuidoc <camindo de entrada>
.
For more options, see the documentation in English.